Στο όνομα της εταιρείας υπάρχει η κομβική λέξη «συνεργασία»
Πράγματι, η ΕΕΟΙΣ στοχεύει στη συνεργασία όλων των σχετικών φορέων, κρατικών, πανεπιστημιακών, ερευνητικών, ασφαλιστικών κλπ, στην Ελλάδα και διεθνώς.

Επιχειρεί έτσι, την όλο και μεγαλύτερη προσέγγιση του καταστατικού της στόχου που είναι η αναβάθμιση των παρεχόμενων στους ασθενείς ομοιοπαθητικών υπηρεσιών υγείας στο ανώτερο επίπεδο δυνατοτήτων του θεραπευτικού αυτού συστήματος, προς όφελος των ασθενών.

Στην Ελλάδα, η ΕΕΟΙΣ συνεργάζεται με άλλες εταιρείες ιατρών και οδοντιάτρων που ασκούν την Ομοιοπαθητική, με εταιρείες φαρμακοποιών εκπαιδευμένων στην παρασκευή ομοιοπαθητικών φαρμάκων, με εταιρείες ασθενών-ληπτών υπηρεσιών Ομοιοπαθητικής Ιατρικής καθώς και με εταιρείες ιατρών που ασκούν άλλες μορφές συμπληρωματικής και εναλλακτικής ιατρικής πχ βελονισμό. Ειδικότερα, η ΕΕΟΙΣ έχει αναπτύξει μία στενή συνεργασία με την Ελληνική Εταιρεία Ομοιοπαθητικής Οδοντιατρικής (ΕΛ.Ε.ΟΜ.Ο), την Ελληνική Εταιρεία Ομοιοπαθητικών φαρμακοποιών και το Σύλλογο Επιστημόνων για την προώθηση της Ομοιοπαθητικής, στελέχη των οποίων συμμετέχουν και στο εκπαιδευτικό πρόγραμμα.

Με όλες αυτές τις δράσεις και τις συνεργασίες της, η ΕΕΟΙΣ συνιστά ένα ενεργό ‘ενδιαφερόμενο μέρος’ (stakeholder) σε όλα τα ελληνικά και διεθνή φόρα και κέντρα λήψης αποφάσεων για την άσκηση και εκπαίδευση στην Ομοιοπαθητική.